高速电主轴单元的内部有两个主要热源：一是电主轴轴承，另一个是内藏式主电动机。其中最突出的问题就是内藏式主电动机的发热。由于主电动机旁边就是电主轴轴承，如果主电动机的散热问题解决不好，还会影响机床工作的可靠性。主要的解决方法是采用循环冷却结构，分外循环和内循环两种，冷却介质可以是水或油，使电动机与前后电主轴轴承都能得到充分冷却。
高速电主轴轴承是电机主轴的核心支承，也是电机主轴的主要热源之一。当前高速电机主轴，大多数采用角接触陶瓷球轴承。由于电机主轴的运转速度高，因此对电主轴轴承的动态、热态性能有严格要求。
角接触球轴承的发热主要是滚动体与滚道之间的滚动摩擦、高速下所受陀螺力矩产生的滑动摩擦以及润滑油的粘性摩擦等产生的。减小轴承发热量的主要措施有：
（1）适当减小滚动体的直径   减小滚动体直径可以减小离心力和陀螺力矩，从而减小摩擦，减少发热量。
（2）采用新材料   比如采用陶瓷材料做滚动体，陶瓷球轴承与钢球角接触球轴承相比，在高速回转时，滚珠与滚道间的滚动和滑动摩擦减小，发热量降低。
（3）采用合理的润滑方式  采用油雾润滑，雾化发生器进气压为0.25~0.3MPa，选用20#透平油，油滴速度控制在80~100滴/min。润滑油雾在充分润滑轴承的同时，还带走了大量的热量。前后电主轴轴承的润滑油分配是非常重要的问题，必须加以严格控制。进气口截面大于前后喷油口截面的总和，排气应顺畅，各喷油小孔的喷射角与轴线呈15o夹角，使油雾直接喷入轴承工作区。